Termin nietolerancja religijna odnosi się do formy nietolerancji wobec wierzeń lub praktyk religijnych lub, w przypadku ich braku, braku takich zwyczajów, które posiada dana osoba lub grupa. Może to być spowodowane kilkoma czynnikami, wśród nich można wymienić fakt posiadania różnych przekonań religijnych, innej ideologii, a także sam fakt posiadania uczuć antyreligijnych. Taka postawa może nawet prowadzić do agresjifizyczny, werbalny, psychologiczny m.in. Wyraźny przykład tego typu nietolerancji w prześladowaniach religijnych, których doświadcza się obecnie w różnych częściach świata. Główną przyczyną tego typu postaw społecznych jest przede wszystkim brak tolerancji religijnej, wolność wyznania oraz pluralizm religijny.
Należy zauważyć, że nie ma jednej przyczyny, która wyjaśniałaby nietolerancję religijną, jednak można mówić o bardzo ogólnym sporze wśród tych, którzy praktykują jedną religię, a nie tolerują innych. Argument ten jest bardzo prosty: na ogół każdy uważa swoją religię za prawdziwą, dlatego też normalne jest, że z ich punktu widzenia sprzeciwiają się tym, którzy bronią fałszywych doktryn.
Jest to zjawisko tak stare, jak właściwe pochodzenie religii. W starożytności, kiedy pierwsi chrześcijanie odprawiali swoje obrzędy, musieli ukrywać się w katakumbach, gdyż ówczesne władze rzymskie nie tolerowały takich wierzeń. Od czasów starożytnych naród żydowski był wielokrotnie w swojej historii ofiarą prześladowań, a główną motywacją do tych prześladowań była właśnie wrogość wobec wyznawanych zwyczajów i wierzeń.
Z drugiej strony religijna wizja ludów prekolumbijskich była zwalczana przez chrześcijan, gdy przybyli na kontynent amerykański. Nawet w samym chrześcijaństwie zdarzały się przypadki nietolerancji wobec innych doktryn chrześcijańskich, które zostały sklasyfikowane jako herezje lub odstępstwa od autentycznej wiary. Wszystkie wspomniane przypadki są oznaką, że odrzucenie i nietolerancja przekonań innych jest stałą, która ma miejsce od niepamiętnych czasów i trwa do dziś.
