Mikroorganizmy można zdefiniować jako rodzaj żywych istot o niewielkich rozmiarach do tego stopnia, że są niewidoczne dla ludzkiego oka. Mogą to być różne typy, wśród najważniejszych możemy wyróżnić glony, grzyby, bakterie itp. Są tacy, którzy podtrzymują hipotezę, że niektóre mikroorganizmy były prekursorami życia na planecie Ziemia, podczas gdy inne nieco bardziej skomplikowane założenia potwierdzają, że są one pochodzenia pozaziemskiego i że w tym czasie rozszerzyły się na powierzchnię planety i dały życie dla wszystkiego, co jest dzisiaj. Ogólnie rzecz biorąc, bardzo często mikroorganizmy składają się z komórki unikalne, jednak nie oznacza to, że nie ma takich, które składają się z więcej niż jednej komórki.
Kierując się potrzebą konfrontacji z chorobami, badanie mikroorganizmów miało ogromny impuls, z tego powodu medycyna ewoluowała w taki sam sposób, jak robiła to wiedza o tych żywych istotach.
Uważa się, że niektóre mikroorganizmy są odpowiedzialne za szkody dla niektórych pokarmów, co może być szkodliwe dla osób, które je spożywały, powodując różne choroby, mimo to istnieją pewne mikroorganizmy, które mogą przyczyniać się do różnych procedur, czego przykładem jest fermentacja, w której wspomniane organizmy są używane do produkcji żywności, takiej jak jogurt lub ser, to znaczy, że istnieją mikroorganizmy, które mogą zmieniać konfigurację niektórych pokarmów lub nawet wydłużać ich żywotność.
Najliczniej występujące w przyrodzie mikroorganizmy to bakterie, które można spotkać w różnych typach siedlisk, są bakterie, które mogą być szkodliwe dla zdrowia człowieka, przykładem jest " Escherichia coli ", który jest odpowiedzialny za choroby, takie jak posocznica. Mimo to istnieją inne bakterie, które mogą być korzystne dla organizmu, przykładem jest "Lactobacillus acidophilus", który ma zdolność wytwarzania różnych substancji, takich jak witamina K i nadtlenek wodoru, co może być bardzo pomocne dla organizm.