Hydrogensomy to najdziwniejsze organelle eukariotyczne o największym na świecie wzroście. Ta organella znajduje się w cytoplazmie, składa się z podwójnej tkanki, w której wewnętrzna błona nadaje grzebień. Hydrogensomy wyewoluowały z mitochondriów w wyniku wycieku elementarnych cech mitochondrialnych, takich jak utrata ich genomu.
Rozmiar tych organelli wynosi około jednej średnicy. Jego główną funkcją jest interwencja w proces metabolizmu fermentacyjnego niektórych istot wybranych do pozyskiwania ATP (cząsteczki energii) w warunkach braku tlenu. Należy zauważyć, że funkcja ta jest podobna do oddychania mitochondrialnego wykonywanego przez mikroorganizmy beztlenowe. W nich rozkładają się kwasy pirogronowe, które są niezbędnymi cząsteczkami w metabolizmie, znajdują się one dokładnie w centrum ścieżek pozyskiwania energii od każdej żywej istoty. Rozkład kwasów pirogronowych jest procesem przeprowadzanym przez hydrogenom, który pochłania CO2, octan, który jest wydalany do cytoplazmy komórki.
Teraz proces wyjaśniony powyżej może opisać ewolucję mitochondriów, jednak należy to ustalić bardzo dokładnie, ponieważ nie wiadomo dokładnie, czy mitochondria i hydrogensomy są organellami, które wyewoluowały razem. W szczególności należałoby zbadać, czy hydrogensomy mają łańcuchy transportu elektronów. Jest to wyjątkowo ważne, ponieważ transport wodoru jest utrudniony w procesie oddychania. Teraz, jeśli oba organelle używają podobnych białek, można wywnioskować, że są one połączone i porównując te białka z podobnymi białkami bakteryjnymi, będzie można naprawdę wiedzieć, czy hydrogenosomy pochodzą z mitochondriów, czy wręcz przeciwnie, mają niezależne pochodzenie
Na koniec należy dodać, że odkrycia tych organelli dokonano w latach 70.