Podziemne miejsce, w którym zwyczajowo chowano zmarłych, na ogół znajdowało się pod główną podłogą kościoła. Krypty znajdowały się w katakumbach, podziemnych galeriach, których głównym celem było grzebanie zwłok, a na ich ostateczny spoczynek umieszczano osobistości religijne, takie jak papieże czy męczennicy. Krypty ozdobiono malowidłami i mozaikami odtwarzającymi sceny z Biblii.
Pierwsze krypty miały na celu ukrycie męczenników profanum i dla nich wykopano je w skałach. To było po tym, jak te kościoły zostały wzniesione nad tymi grobami.
Obecnie komory skalne, w których znajdują się ciała zmarłych, znane są jako krypty, które mogą znajdować się w katedrach, ale także na publicznych lub prywatnych cmentarzach, a co za tym idzie w miejscach istniejących w każdym podziemnym budynku.
Z czasem krypty zaczęto wbudowywać w cmentarze. Funkcja pozostaje niezmieniona od samego początku: w tego typu miejscach deponowane są szczątki ludzi. Jeśli krypta zbudowana jest na poziomie z ziemi, zwany mauzoleum.
Miejscami pochówku były zwykle podziemne galerie wykopane w ziemi, zwane także katakumbami. Było w nich specyficzne miejsce przeznaczone do grzebania zmarłych, a miejscem tym była krypta. W większości krypty posiadały w suficie świetlik, ułatwiający doświetlenie i wentylację pomieszczenia. Oprócz funkcji cmentarza miejsce to służyło również do kultu religijnego.
W każdym razie katakumby, w których budowano krypty, były budowane do czasu, gdy cesarz Teodozjusz uczynił chrześcijaństwo oficjalną religią Cesarstwa Rzymskiego w 380 r.
Z drugiej strony w botanice krypta to głęboka dziura, którą mają niektóre warzywa. Na przykład liście niektórych roślin kserofitycznych mogą mieć aparaty szparkowe ukryte w kryptach, czyli w dziurach (kryptach aparatów szparkowych).
Wiele dzisiejszych kościołów chrześcijańskich zostało zbudowanych na oryginalnych katakumbach i kryptach. Te miejsca są nadal odwiedzane przez niektórych pielgrzymów. Można w nich odnaleźć grobowce świętych i męczenników wczesnego kościoła chrześcijańskiego, a jednocześnie poznać symboliczne elementy sztuki wczesnochrześcijańskiej (krzyż nawiązujący do postaci Chrystusa, wizerunki Dobrego Pasterza, obrazy Pawia jako reprezentacji nieśmiertelności duszy lub Kotwicy, która symbolizuje przyszłe życie).
